More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3924 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  754    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 
415 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
385 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 
391 aa  199  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  36.49 
 
 
386 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  35.49 
 
 
388 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
411 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  29.05 
 
 
405 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
420 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  29.08 
 
 
384 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
396 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.19 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  26.83 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  28.06 
 
 
406 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  26.83 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
388 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  27.13 
 
 
432 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
399 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
381 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  26.72 
 
 
409 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  26.86 
 
 
432 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
400 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
439 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  26.26 
 
 
474 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  28.41 
 
 
404 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  29.61 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.56 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  26.91 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  25.44 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  34.55 
 
 
474 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.19 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  29.73 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  24.49 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.49 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  28.53 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  26.99 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  28.14 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  24.78 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  22.42 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  33.89 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.98 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24.4 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  22.42 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.72 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  24.07 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  21.55 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  24.93 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1846  transporter protein  31.49 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.958956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  21.82 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  22.12 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.13 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  28.72 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.69 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  26.36 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4363  major facilitator transporter  25.94 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.72 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  24.93 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.15 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  34.48 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  31.58 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  31.58 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  31.58 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.44 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  28.02 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
528 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.47 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  30.32 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  28.09 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  28.09 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 
529 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  25.62 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  27.71 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  30.13 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 
458 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 
484 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>