29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3891 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  82.82 
 
 		 613 aa  1025    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  53.19 
 
 		 1065 aa  662    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  54.46 
 
 		 618 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 662 aa  1343    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  52.33 
 
 		 676 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  51.26 
 
 		 1880 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  51.39 
 
 		 914 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  50.16 
 
 		 677 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  49.43 
 
 		 672 aa  608  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  52.52 
 
 		 820 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  49.17 
 
 		 787 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  52.48 
 
 		 746 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.25 
 
 		 833 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.94 
 
 		 773 aa  582  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  48.94 
 
 		 1266 aa  579  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  50.5 
 
 		 743 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  49.16 
 
 		 744 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  51.07 
 
 		 774 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  45.62 
 
 		 658 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  43.53 
 
 		 616 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  51.55 
 
 		 669 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.47 
 
 		 848 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  43.14 
 
 		 1082 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  42.68 
 
 		 767 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  42.12 
 
 		 851 aa  291  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  41.4 
 
 		 803 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  33.54 
 
 		 606 aa  229  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  48.63 
 
 		 240 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2353  hypothetical protein  22.22 
 
 		 667 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>