28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3890 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3891  FG-GAP repeat protein  82.82 
 
 		 662 aa  1024    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0201045  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3890  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 613 aa  1242    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.100975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  53.72 
 
 		 1065 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1678  FG-GAP repeat-containing protein  55.3 
 
 		 618 aa  657    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000385209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  50.9 
 
 		 676 aa  609  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  50.73 
 
 		 1880 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  49.19 
 
 		 914 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  51.32 
 
 		 820 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3679  FG-GAP repeat-containing protein  49.04 
 
 		 677 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000668501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.92 
 
 		 833 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  50.98 
 
 		 746 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0215  hypothetical protein  47.47 
 
 		 787 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.247973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3413  FG-GAP repeat protein  48.14 
 
 		 672 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  48.79 
 
 		 1266 aa  568  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  49.84 
 
 		 743 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  47.65 
 
 		 773 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  48.03 
 
 		 744 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  48.94 
 
 		 774 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1343  YesW  45.48 
 
 		 658 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4222  FG-GAP repeat-containing protein  42.97 
 
 		 616 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  51.43 
 
 		 669 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  37.34 
 
 		 848 aa  339  9e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25650  FG-GAP repeat protein  41.85 
 
 		 1082 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112985  normal  0.313827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3493  FG-GAP repeat protein  41.4 
 
 		 767 aa  279  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.832541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0488  FG-GAP repeat protein  40.34 
 
 		 851 aa  278  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0343  FG-GAP repeat-containing protein  39.07 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02543  rhamnogalacturonan lyase (Eurofung)  32.92 
 
 		 606 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2008  putative secreted glycosyl hydrolase  50.19 
 
 		 240 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>