62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3839 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  49.28 
 
 
138 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  32.88 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  33.61 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  30.1 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  28.69 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  28.69 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  31.54 
 
 
187 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  27.07 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  27.94 
 
 
179 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  34.29 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  33.88 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  31.85 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  29.75 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  33.9 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  29.52 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  31.71 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  31.71 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  29.13 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.5 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  30.3 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  31.15 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  31.15 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  29.69 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  32.28 
 
 
146 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  29.32 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  27.2 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  27.94 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  28.35 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5706  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0513889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.55 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.71 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  26.24 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  34.41 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  28.46 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  26.79 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  29.11 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  33.7 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  28.45 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.13 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  27.78 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  33 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  24.65 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  27.2 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  27.2 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  27.2 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  27.66 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  29.21 
 
 
146 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  26.71 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.59 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  30.4 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  27.13 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  25.21 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>