More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3665 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
860 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
860 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
813 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
824 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
868 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
873 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
863 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
860 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1659  leucyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
875 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.141591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
862 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
861 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
868 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
819 aa  705    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
859 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
868 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
815 aa  680    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
862 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
894 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
860 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
823 aa  680    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
823 aa  679    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
868 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
813 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
860 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
830 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
862 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
860 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
829 aa  733    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
860 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
860 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
872 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
824 aa  712    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
819 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
868 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
828 aa  711    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
851 aa  713    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
827 aa  698    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
884 aa  656    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
875 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
824 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
829 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
877 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
825 aa  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
874 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
820 aa  663    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
865 aa  686    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
860 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
862 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
829 aa  712    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
906 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
824 aa  719    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
880 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
848 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
865 aa  663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
824 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
874 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
819 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
868 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
817 aa  680    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
817 aa  721    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
826 aa  751    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
872 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
826 aa  656    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
863 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
878 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
856 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
874 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
859 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
856 aa  708    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
825 aa  719    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
820 aa  664    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
878 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
906 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
817 aa  668    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
859 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
871 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
859 aa  681    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
816 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
860 aa  656    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  47 
 
 
929 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
859 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
859 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
864 aa  704    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
872 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
824 aa  689    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
865 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1579  leucyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
901 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  0.048228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
873 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
864 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
860 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
823 aa  715    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
829 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
859 aa  681    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
859 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2912  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
880 aa  644    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
870 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
823 aa  748    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
868 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
860 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
864 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>