93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3601 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  63.19 
 
 
170 aa  224  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  34.71 
 
 
231 aa  88.6  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  34.93 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  35.06 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  29.23 
 
 
283 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  26.71 
 
 
127 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  27.46 
 
 
255 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  29.79 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  25 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  32.56 
 
 
247 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  30.91 
 
 
514 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.17 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  31.03 
 
 
219 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  30.86 
 
 
229 aa  50.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  31.37 
 
 
504 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  31.72 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  28.21 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  31.82 
 
 
522 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  27.33 
 
 
472 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  30.14 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.86 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  38.96 
 
 
555 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  27.73 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  27.78 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  31.58 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  29.55 
 
 
282 aa  47.8  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  26.27 
 
 
558 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.09 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  28 
 
 
472 aa  47.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  33.02 
 
 
189 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 
174 aa  47.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  30.86 
 
 
179 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  29.21 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  28.3 
 
 
472 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  27.67 
 
 
472 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  28.3 
 
 
472 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  27.36 
 
 
172 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 
472 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.58 
 
 
153 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  36.25 
 
 
471 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  32.63 
 
 
1510 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  28.85 
 
 
472 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  31.48 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  33.78 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  36.25 
 
 
453 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  29.73 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  33.8 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  23.26 
 
 
146 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.12 
 
 
513 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  31.52 
 
 
472 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  37.29 
 
 
555 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  33.9 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  28.09 
 
 
229 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  30.06 
 
 
491 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 
575 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  25.74 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  28 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  27.64 
 
 
476 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  29.11 
 
 
530 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  35.79 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  29.21 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  29.47 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  24.68 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  30.36 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 
469 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  29.69 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  30.84 
 
 
561 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  27.2 
 
 
479 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  30.34 
 
 
542 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  28.17 
 
 
511 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  31.82 
 
 
443 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 
232 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  32.26 
 
 
493 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  25.19 
 
 
492 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.69 
 
 
579 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  32.38 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  28.24 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  29.27 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  25.45 
 
 
172 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  25.42 
 
 
480 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>