31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3256 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  70.34 
 
 		 491 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  100 
 
 		 477 aa  932    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  52.94 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  53.59 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  58.68 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  44.11 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  44.64 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  43.1 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  39.24 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  42.55 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  41.76 
 
 		 408 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  57.95 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  60.69 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  41.81 
 
 		 440 aa  317  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  52.81 
 
 		 443 aa  296  8e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  54.02 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  38.16 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  37.74 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  37.53 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  45.66 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  44.75 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  43.89 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  45.04 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  45.42 
 
 		 407 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  44.27 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  48.29 
 
 		 426 aa  239  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  42.12 
 
 		 413 aa  233  5e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  42.92 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  32.11 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  41.94 
 
 		 573 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  32.56 
 
 		 599 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>