More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3105 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
819 aa  1625    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  61.08 
 
 
832 aa  1000    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  78.23 
 
 
827 aa  1292    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  81.23 
 
 
825 aa  1298    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  42.03 
 
 
583 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  40.37 
 
 
615 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  33.41 
 
 
796 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  42.88 
 
 
594 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  42.13 
 
 
574 aa  385  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
607 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  39.56 
 
 
560 aa  376  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  40.45 
 
 
561 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  42.59 
 
 
595 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  41.2 
 
 
679 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  33.22 
 
 
882 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  34.19 
 
 
879 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  41.41 
 
 
526 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  41.62 
 
 
544 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  39.68 
 
 
566 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  41.76 
 
 
680 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  41.24 
 
 
678 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  40.86 
 
 
671 aa  366  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  38.92 
 
 
669 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  39.19 
 
 
641 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  42.11 
 
 
588 aa  364  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  40.15 
 
 
641 aa  364  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  42.1 
 
 
554 aa  364  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  42.13 
 
 
580 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  40.11 
 
 
603 aa  364  4e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  34.28 
 
 
879 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  34.28 
 
 
879 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  39.51 
 
 
551 aa  362  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  40.86 
 
 
543 aa  362  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  39.93 
 
 
582 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  39.45 
 
 
558 aa  361  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  40.12 
 
 
598 aa  361  3e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  31.56 
 
 
806 aa  360  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  39.88 
 
 
644 aa  360  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  41.94 
 
 
563 aa  360  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  40.91 
 
 
572 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  40.66 
 
 
544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  38.97 
 
 
609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  40.94 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  38.5 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  40.15 
 
 
539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  41.73 
 
 
575 aa  358  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  38.97 
 
 
533 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  40.56 
 
 
586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  41.02 
 
 
568 aa  357  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 
544 aa  357  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  41.35 
 
 
575 aa  357  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  41.35 
 
 
559 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  40.27 
 
 
529 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  39.96 
 
 
548 aa  355  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  41.52 
 
 
557 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  40.69 
 
 
596 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  39.77 
 
 
547 aa  355  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  39.57 
 
 
648 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  39.58 
 
 
581 aa  354  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  33.65 
 
 
874 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  39.03 
 
 
536 aa  354  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  40.79 
 
 
589 aa  353  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  37.1 
 
 
662 aa  354  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  41.18 
 
 
560 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  39.69 
 
 
556 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  39.89 
 
 
552 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  40.37 
 
 
560 aa  353  7e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  40.55 
 
 
567 aa  353  7e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  353  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  353  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  39.73 
 
 
535 aa  353  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  353  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  353  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  353  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  39.69 
 
 
539 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 
535 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  38.79 
 
 
534 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  39.44 
 
 
567 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  39.49 
 
 
564 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  40.81 
 
 
538 aa  352  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  40.62 
 
 
538 aa  352  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  39.81 
 
 
535 aa  352  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  40.66 
 
 
526 aa  352  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  40.04 
 
 
534 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  40.53 
 
 
594 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  40.81 
 
 
588 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  31.54 
 
 
818 aa  351  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  40.04 
 
 
534 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  40.04 
 
 
534 aa  351  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  39.61 
 
 
535 aa  351  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 
544 aa  350  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  37.8 
 
 
638 aa  350  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  37.72 
 
 
620 aa  350  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  32.27 
 
 
877 aa  350  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  39.16 
 
 
531 aa  350  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  40.08 
 
 
544 aa  350  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  41.52 
 
 
589 aa  350  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  40 
 
 
516 aa  349  1e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  39.61 
 
 
535 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>