More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3036 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 
382 aa  773    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  86.91 
 
 
382 aa  677    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  74.93 
 
 
382 aa  586  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  67.89 
 
 
378 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  61.46 
 
 
379 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.05 
 
 
377 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  50 
 
 
372 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  48.68 
 
 
372 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  48.94 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  48.41 
 
 
382 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  48.15 
 
 
382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  48.15 
 
 
371 aa  352  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  47.88 
 
 
371 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  47.88 
 
 
371 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  47.88 
 
 
371 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  47.88 
 
 
371 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  47.88 
 
 
382 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  47.88 
 
 
382 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  47.35 
 
 
386 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.07 
 
 
385 aa  344  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.03 
 
 
379 aa  338  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  45.41 
 
 
373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  43.83 
 
 
373 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  43.83 
 
 
373 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.36 
 
 
430 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  44.18 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.21 
 
 
370 aa  325  8.000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  45.34 
 
 
373 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.5 
 
 
375 aa  322  5e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.26 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.6 
 
 
373 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.42 
 
 
390 aa  316  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  43.04 
 
 
374 aa  315  9e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.54 
 
 
397 aa  310  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  43.72 
 
 
383 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  43.72 
 
 
389 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.26 
 
 
409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  44.47 
 
 
375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  42.23 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  42.23 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  43.95 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  43.95 
 
 
381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  44.47 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.36 
 
 
380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  42.59 
 
 
374 aa  301  8.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  43.68 
 
 
381 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  44.47 
 
 
397 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.45 
 
 
378 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.23 
 
 
387 aa  300  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  43.42 
 
 
378 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  43.42 
 
 
381 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  43.57 
 
 
397 aa  299  5e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.07 
 
 
404 aa  298  8e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  44.24 
 
 
386 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  44.47 
 
 
396 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  43.11 
 
 
412 aa  297  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  43.34 
 
 
387 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  42.59 
 
 
386 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  42.59 
 
 
386 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.63 
 
 
377 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.88 
 
 
378 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  43.31 
 
 
396 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.27 
 
 
380 aa  292  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.24 
 
 
409 aa  291  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  38.67 
 
 
375 aa  290  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  42.22 
 
 
378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  39.95 
 
 
395 aa  289  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  41.67 
 
 
391 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  43.01 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  41.15 
 
 
377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.58 
 
 
367 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.58 
 
 
367 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  40.91 
 
 
373 aa  279  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  41.91 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  41.32 
 
 
391 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.85 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  40.43 
 
 
378 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  39.68 
 
 
371 aa  269  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  38.89 
 
 
473 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.3 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  39.38 
 
 
379 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  41.67 
 
 
374 aa  266  4e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  42.66 
 
 
355 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  39.07 
 
 
396 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  38.8 
 
 
373 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  38.6 
 
 
378 aa  263  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  38.25 
 
 
372 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  38.25 
 
 
372 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  38.25 
 
 
373 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  38.25 
 
 
372 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  38.25 
 
 
373 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  38.25 
 
 
373 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.4 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  39.21 
 
 
374 aa  262  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.05 
 
 
380 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  38.25 
 
 
373 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  37.67 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  37.93 
 
 
375 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  37.93 
 
 
375 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  39.02 
 
 
427 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>