52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2972 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 480 aa  947    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 504 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 492 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 470 aa  106  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.35 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  29.64 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.76 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 486 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  19.91 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 482 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  22.58 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 547 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  25.74 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  29.37 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0294  polysaccharide biosynthesis protein  30.72 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.27 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  20.61 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 135 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  20.61 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 472 aa  43.5  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 490 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.22 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 		 508 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>