More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2963 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  79.09 
 
 
510 aa  846    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  87.45 
 
 
527 aa  926    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  100 
 
 
513 aa  1046    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  79.22 
 
 
513 aa  844    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1472  glycerol kinase  77.51 
 
 
510 aa  834    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  57.84 
 
 
497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  57.99 
 
 
496 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  58.02 
 
 
498 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  57.99 
 
 
496 aa  596  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  57.06 
 
 
503 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  55.06 
 
 
507 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  55.06 
 
 
507 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  55.06 
 
 
507 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  55.34 
 
 
502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.17 
 
 
496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  55.34 
 
 
502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  55.34 
 
 
502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  55.34 
 
 
502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.48 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  53.48 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  55.34 
 
 
502 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.28 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.08 
 
 
496 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.28 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.28 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.08 
 
 
496 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  54.79 
 
 
501 aa  570  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  57.06 
 
 
505 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  54.55 
 
 
505 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.28 
 
 
496 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.28 
 
 
496 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  54.01 
 
 
505 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  54.56 
 
 
502 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.05 
 
 
499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  56.18 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  53.91 
 
 
503 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.5 
 
 
501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  53.61 
 
 
502 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  54.78 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.98 
 
 
502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  56.81 
 
 
501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  53.68 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  52.33 
 
 
507 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  53.74 
 
 
499 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  54 
 
 
503 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  53.71 
 
 
503 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53.95 
 
 
499 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  54.35 
 
 
499 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  53.91 
 
 
503 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  53.27 
 
 
520 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  53.54 
 
 
499 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1800  glycerol kinase  51.61 
 
 
532 aa  552  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  0.482844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  53.36 
 
 
499 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.95 
 
 
494 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  52.2 
 
 
498 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  52.2 
 
 
498 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  52.75 
 
 
503 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.75 
 
 
503 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  53.61 
 
 
500 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  53.66 
 
 
499 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  54.4 
 
 
505 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  52.8 
 
 
504 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  54.21 
 
 
505 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  53.54 
 
 
505 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  52.75 
 
 
500 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  52.56 
 
 
501 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.75 
 
 
518 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52.75 
 
 
518 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.75 
 
 
518 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.75 
 
 
518 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.75 
 
 
518 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  54.03 
 
 
498 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  52.15 
 
 
505 aa  545  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  52.35 
 
 
500 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  53.82 
 
 
516 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  52.16 
 
 
505 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.75 
 
 
494 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.16 
 
 
500 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  52.35 
 
 
500 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  53.61 
 
 
507 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  54.3 
 
 
505 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  53.36 
 
 
494 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>