31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2925 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2925  Ribosomal protein L37e  100 
 
 
58 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1067  Ribosomal protein L37e  93.1 
 
 
58 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2096  Ribosomal protein L37e  87.72 
 
 
57 aa  104  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2045  50S ribosomal protein L37e  79.31 
 
 
58 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0509029  normal  0.0973133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0673  50S ribosomal protein L37e  80.7 
 
 
57 aa  95.9  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.638312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0395  50S ribosomal protein L37e  62 
 
 
60 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0295683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0094  50S ribosomal protein L37e  60 
 
 
60 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0438  50S ribosomal protein L37e  60.78 
 
 
64 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0397  50S ribosomal protein L37e  60.78 
 
 
64 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1522  50S ribosomal protein L37e  58.82 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0495076  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0291  50S ribosomal protein L37e  58.82 
 
 
62 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3060  50S ribosomal protein L37e  60 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2180  50S ribosomal protein L37e  56 
 
 
56 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0229  50S ribosomal protein L37e  56 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.409519  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0469  50S ribosomal protein L37e  56.86 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.39506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0231  50S ribosomal protein L37e  53.85 
 
 
56 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3499  50S ribosomal protein L37e  56 
 
 
56 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0696455  normal  0.486472 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1813  Ribosomal protein L37e  54.9 
 
 
61 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76246  predicted protein  51.92 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304139  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0420  50S ribosomal protein L37e  50.98 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2252  50S ribosomal protein L37e  52.94 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2140  50S ribosomal protein L37e  56.25 
 
 
52 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00700  PRCDNA38, putative  46.3 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0039  50S ribosomal protein L37e  52.08 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00771386 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0042  50S ribosomal protein L37e  52.08 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.558285  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32818  Ribosomal protein L37, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  48.08 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.973212 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10196  predicted protein  53.19 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609433  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1082  50S ribosomal protein L37e  50 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.247855  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0220  50S ribosomal protein L37e  47.06 
 
 
55 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1390  Ribosomal protein L37e  49.02 
 
 
55 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434822  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0164  50S ribosomal protein L37e  47.5 
 
 
61 aa  41.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.11275  normal  0.178232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>