More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2793 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  100 
 
 		 702 aa  1399    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0675  Transketolase central region  60.51 
 
 		 327 aa  379  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.045738  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  33.82 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  56.97 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  37.59 
 
 		 657 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  55.92 
 
 		 342 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  37.52 
 
 		 710 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  33.18 
 
 		 658 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  54.93 
 
 		 346 aa  353  7e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  36.68 
 
 		 675 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  33.14 
 
 		 659 aa  351  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  32.7 
 
 		 668 aa  348  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  33.48 
 
 		 659 aa  346  8.999999999999999e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2648  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  47.65 
 
 		 365 aa  340  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  53.38 
 
 		 325 aa  337  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  53.97 
 
 		 320 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  50.62 
 
 		 326 aa  333  6e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  50.93 
 
 		 326 aa  333  7.000000000000001e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  54.57 
 
 		 328 aa  330  7e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  53.14 
 
 		 326 aa  329  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  54.26 
 
 		 320 aa  329  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  55.14 
 
 		 324 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  53.63 
 
 		 320 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  53.31 
 
 		 320 aa  327  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2647  transketolase, central region  53.5 
 
 		 326 aa  327  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  56.65 
 
 		 320 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0139  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  51.97 
 
 		 375 aa  323  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  53.58 
 
 		 324 aa  323  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  53.58 
 
 		 324 aa  323  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  53.58 
 
 		 324 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0674  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  49.45 
 
 		 371 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135332  normal  0.240867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2655  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  54.23 
 
 		 320 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  50.93 
 
 		 325 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  54.09 
 
 		 326 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  50.16 
 
 		 324 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  32.92 
 
 		 736 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  55 
 
 		 325 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  49.84 
 
 		 324 aa  320  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1668  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  48.03 
 
 		 369 aa  319  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  52.2 
 
 		 326 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  54.17 
 
 		 326 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  52.85 
 
 		 330 aa  318  3e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3008  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  51.3 
 
 		 387 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  53.21 
 
 		 332 aa  317  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3597  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  47.09 
 
 		 375 aa  316  9e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  33.92 
 
 		 678 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  54.11 
 
 		 326 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  51.57 
 
 		 326 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3246  transketolase, central region  51.25 
 
 		 334 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  51.42 
 
 		 322 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  50.93 
 
 		 327 aa  310  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3747  Transketolase central region  51.75 
 
 		 355 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  52.68 
 
 		 326 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0238  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  53.85 
 
 		 326 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.26153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  51.56 
 
 		 335 aa  306  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2852  Transketolase central region  49.85 
 
 		 331 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1710  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  50 
 
 		 333 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  51.25 
 
 		 328 aa  305  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  32.92 
 
 		 701 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  36.08 
 
 		 709 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19910  putative pyruvate dehydrogenase E1 component, beta chain  49.69 
 
 		 333 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.045452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3894  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  46.05 
 
 		 382 aa  299  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.361042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3319  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  45.88 
 
 		 359 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  49.23 
 
 		 326 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1798  putative pyruvate decarboxylase E1 (Beta subunit) oxidoreductase protein  50.94 
 
 		 326 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.044195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2192  Transketolase central region  53.31 
 
 		 323 aa  296  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0181  putative branched-chain alpha keto acid dehydrogenase E1 beta subunit  50.47 
 
 		 327 aa  295  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2037  transketolase, central region  47.38 
 
 		 325 aa  294  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  32.28 
 
 		 669 aa  294  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  33.85 
 
 		 692 aa  294  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  46.67 
 
 		 337 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3381  Transketolase central region  50.61 
 
 		 357 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410697  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  48.76 
 
 		 325 aa  293  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4398  Transketolase central region  52.26 
 
 		 325 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.45 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.45 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.56 
 
 		 325 aa  291  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  48.56 
 
 		 325 aa  291  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  48.56 
 
 		 325 aa  291  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  33.38 
 
 		 692 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  48.14 
 
 		 325 aa  290  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  46.27 
 
 		 337 aa  289  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.67 
 
 		 337 aa  289  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.74 
 
 		 325 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0226  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.18 
 
 		 329 aa  288  2e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.67 
 
 		 337 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1562  transketolase, central region  51.86 
 
 		 334 aa  288  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.386983  normal  0.558748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  50.31 
 
 		 345 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.83 
 
 		 351 aa  287  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3553  transketolase  45.64 
 
 		 345 aa  287  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl040  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.11 
 
 		 329 aa  287  5.999999999999999e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  48.78 
 
 		 342 aa  287  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  47.6 
 
 		 338 aa  286  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3161  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  43.4 
 
 		 360 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>