More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2787 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1764  threonyl-tRNA synthetase  68.26 
 
 
649 aa  904    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0076873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0955  threonyl-tRNA synthetase  90 
 
 
650 aa  1170    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.94017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1389  threonyl-tRNA synthetase  65.57 
 
 
640 aa  844    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210838  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2787  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
649 aa  1315    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
635 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
639 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
635 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
639 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
636 aa  582  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
633 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
639 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
640 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
645 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
639 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
636 aa  568  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
636 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
639 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
645 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
636 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
639 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
640 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
635 aa  568  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
640 aa  565  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
635 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
636 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
644 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
644 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
634 aa  561  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
644 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
638 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
637 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
634 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
631 aa  555  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
638 aa  558  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
646 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
643 aa  554  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
639 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
648 aa  555  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
648 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
643 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
637 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
662 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
637 aa  539  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
649 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
646 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
644 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
634 aa  534  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
636 aa  528  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
647 aa  530  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
643 aa  530  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
640 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
645 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
643 aa  527  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
644 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
648 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
641 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
640 aa  522  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
638 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
645 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
602 aa  524  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
646 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
636 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
645 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
659 aa  524  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
642 aa  524  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
638 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
648 aa  518  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
642 aa  522  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
644 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
649 aa  518  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  45.32 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02485  threonyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
635 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
646 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
642 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
641 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
640 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1840  threonyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
642 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302796  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
604 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
644 aa  515  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
633 aa  512  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
635 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
638 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1428  threonyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
642 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00369354  hitchhiker  0.00283181 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
588 aa  515  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
635 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>