More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2515 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.49 
 
 		 663 aa  1011    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 634 aa  1218    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.48 
 
 		 606 aa  610  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.01 
 
 		 597 aa  557  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.7 
 
 		 565 aa  536  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 		 572 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  35.26 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 		 540 aa  165  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 		 565 aa  157  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.16 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.48 
 
 		 551 aa  146  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 550 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 		 579 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.64 
 
 		 551 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 		 572 aa  133  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 		 561 aa  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  30.87 
 
 		 521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 		 547 aa  120  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.18 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 		 518 aa  114  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.79 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  39.34 
 
 		 592 aa  107  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  25.42 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  25.93 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 		 569 aa  103  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.66 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 		 545 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28 
 
 		 536 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  27.43 
 
 		 536 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  28.81 
 
 		 535 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  28.81 
 
 		 535 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  28.81 
 
 		 535 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  27.62 
 
 		 536 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 		 579 aa  98.2  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  27.62 
 
 		 536 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  37.88 
 
 		 504 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 		 512 aa  97.8  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.94 
 
 		 530 aa  97.8  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  37.88 
 
 		 504 aa  97.8  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  27.62 
 
 		 536 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  27.62 
 
 		 536 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  27.24 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  27.05 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  27.84 
 
 		 509 aa  94.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  27.45 
 
 		 536 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 		 563 aa  94  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 587 aa  94  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  36.67 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  23.9 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 		 220 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  24.55 
 
 		 534 aa  92.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 		 558 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 		 601 aa  91.3  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  30.96 
 
 		 226 aa  90.5  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 		 528 aa  90.5  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  27.68 
 
 		 543 aa  90.5  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 		 569 aa  90.1  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 		 728 aa  89.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  37.63 
 
 		 542 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 		 732 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  35.75 
 
 		 535 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 597 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.48 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 		 602 aa  87.4  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.2 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  33.82 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  32.88 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  33.63 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.12 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  26.52 
 
 		 589 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  30.69 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  29.84 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.31 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.98 
 
 		 590 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  37.5 
 
 		 269 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  25.98 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.98 
 
 		 589 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5873  putative transmembrane component of ABC transporter  33.33 
 
 		 294 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469705  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  27.34 
 
 		 536 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  23.84 
 
 		 685 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.76 
 
 		 590 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  33.33 
 
 		 535 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  27.34 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>