More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2452 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 345 aa  679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.58 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.37 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.25 
 
 		 335 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.04 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  35.1 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.58 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.24 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.07 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.21 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.85 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.33 
 
 		 350 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.12 
 
 		 314 aa  166  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 		 323 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.12 
 
 		 314 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.14 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.05 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.43 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  38.04 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  31.37 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  31.84 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  34.47 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.94 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.04 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  31.66 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.95 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.23 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.83 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.26 
 
 		 363 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.98 
 
 		 492 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.13 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  31.37 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.37 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  31.1 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  31.1 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.5 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.63 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.1 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.99 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.61 
 
 		 378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  32.45 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.25 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.95 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  31.74 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.56 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.59 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.65 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.82 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.34 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.33 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.02 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.46 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.1 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  40.53 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.7 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.05 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.05 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.06 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.05 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.13 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.58 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.43 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.63 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.3 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  37.54 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.52 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.28 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  37.65 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  37.54 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.14 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.15 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.13 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.71 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.43 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.77 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.11 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.6 
 
 		 362 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.02 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.32 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.45 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.84 
 
 		 380 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.75 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.75 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.77 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  29.81 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3829  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.24 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.92 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  31.29 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.11 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.43 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.56 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.18 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.64 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  36.4 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.57 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.86 
 
 		 325 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.65 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.36 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>