More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2405 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
518 aa  1026    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  36.49 
 
 
516 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  33.47 
 
 
545 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.44 
 
 
524 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 
519 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.32 
 
 
520 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  31.29 
 
 
527 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.12 
 
 
525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.66 
 
 
532 aa  216  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  31.04 
 
 
522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.15 
 
 
524 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 
517 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.27 
 
 
521 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.27 
 
 
521 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 
521 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
521 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.27 
 
 
521 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
537 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.69 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
510 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.41 
 
 
521 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
528 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
500 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.46 
 
 
509 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.77 
 
 
541 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 
507 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.56 
 
 
510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  32.34 
 
 
510 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.15 
 
 
538 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 
533 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  32.49 
 
 
521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 
521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.85 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
528 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 
517 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
534 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.04 
 
 
531 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 
512 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.63 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 
529 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
522 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
511 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 
506 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.84 
 
 
505 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 
502 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
538 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 
505 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
523 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
551 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 
551 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
522 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.77 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.07 
 
 
504 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
595 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
529 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 
515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
529 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.8 
 
 
524 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
490 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.55 
 
 
516 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
567 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
514 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  26.55 
 
 
516 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
515 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 
509 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
516 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.55 
 
 
516 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.82 
 
 
523 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.1 
 
 
532 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
516 aa  160  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
525 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.46 
 
 
567 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
526 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
510 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.05 
 
 
566 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.46 
 
 
502 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 
565 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.33 
 
 
516 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
522 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
607 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 
509 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 
565 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
564 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.52 
 
 
580 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.52 
 
 
579 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
539 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 
523 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
495 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
544 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.85 
 
 
515 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.26 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.31 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
512 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
512 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
512 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>