More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2375 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  100 
 
 
347 aa  696    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  65.14 
 
 
373 aa  441  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  43.2 
 
 
437 aa  278  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  43.22 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  41.54 
 
 
299 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  39.26 
 
 
308 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  39.73 
 
 
340 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  37.79 
 
 
335 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  39.93 
 
 
307 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  40.22 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  42.53 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  40.71 
 
 
311 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  39.82 
 
 
311 aa  177  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  37.86 
 
 
418 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  34.35 
 
 
316 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  34.35 
 
 
316 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.14 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  31.14 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  29.62 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  30.17 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.13 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.37 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  29.41 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  28.74 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  28.74 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  28.74 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  29.73 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.87 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  26.05 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.61 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  27.52 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  29.27 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  28.7 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  29.27 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.09 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  27.67 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  28.43 
 
 
273 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  23.95 
 
 
266 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.29 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.91 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  26.29 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.13 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.24 
 
 
268 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  29.6 
 
 
268 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.83 
 
 
263 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  25 
 
 
269 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  26.52 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.05 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.17 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  28.5 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  26.73 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.05 
 
 
276 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.61 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  27.11 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  26.89 
 
 
322 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  28.11 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.24 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  28.01 
 
 
270 aa  60.1  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.85 
 
 
267 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  25.85 
 
 
267 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  26.74 
 
 
278 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  26.67 
 
 
307 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  26.95 
 
 
272 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.95 
 
 
272 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.11 
 
 
265 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.26 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  28 
 
 
268 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  27.67 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  26.32 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  26.15 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  24.39 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  26.58 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  25.88 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  28.77 
 
 
282 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25.79 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  25.48 
 
 
260 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  27.46 
 
 
280 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.6 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.56 
 
 
267 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  25.89 
 
 
267 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  28.19 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.7 
 
 
278 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  28.71 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  28.02 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  30.09 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  27.6 
 
 
285 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  26.46 
 
 
4979 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  27.04 
 
 
620 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  24.43 
 
 
266 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  27.52 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  27.52 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  26.17 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.51 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  26.24 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  25.76 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  28.18 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  25.76 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  29.18 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.37 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>