More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1898 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 592 aa  1174    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  63.26 
 
 		 553 aa  683    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  73.41 
 
 		 610 aa  842    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  57.69 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  40.98 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  43.99 
 
 		 556 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  39.97 
 
 		 567 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  43.97 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.35 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  40.58 
 
 		 547 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  42.66 
 
 		 548 aa  389  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  39.53 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.09 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.46 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.03 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.85 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33 
 
 		 573 aa  317  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  34.63 
 
 		 584 aa  293  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  35.83 
 
 		 584 aa  293  9e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  34.58 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  35.27 
 
 		 584 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  33.86 
 
 		 603 aa  281  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.3 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  30.96 
 
 		 576 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.17 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  40.66 
 
 		 513 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  39.3 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  38.66 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  31.4 
 
 		 598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  38.77 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.11 
 
 		 601 aa  253  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.36 
 
 		 588 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  32.7 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  33.68 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.17 
 
 		 531 aa  247  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.85 
 
 		 582 aa  240  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.78 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  39.29 
 
 		 527 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.05 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  40.75 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  37.02 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.48 
 
 		 583 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  38.07 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  41.39 
 
 		 519 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.89 
 
 		 506 aa  223  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  39.47 
 
 		 537 aa  220  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  38.51 
 
 		 507 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  37.61 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  37.61 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  37.61 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.89 
 
 		 1017 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  30.9 
 
 		 803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  36.27 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  34.71 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  36.17 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.76 
 
 		 522 aa  191  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  34.66 
 
 		 517 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.13 
 
 		 592 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.85 
 
 		 719 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  33.47 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  31.85 
 
 		 533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  30.13 
 
 		 584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  28.77 
 
 		 554 aa  174  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  32.73 
 
 		 532 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  25.65 
 
 		 932 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  32.55 
 
 		 558 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  31.83 
 
 		 533 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  28.67 
 
 		 530 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  28.1 
 
 		 551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  36.18 
 
 		 522 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  28.42 
 
 		 535 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  30.59 
 
 		 648 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 558 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  31.91 
 
 		 622 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  33.49 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  25.82 
 
 		 651 aa  161  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  31.22 
 
 		 544 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  25.92 
 
 		 664 aa  160  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  32 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  38.7 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  33.79 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  33.14 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  28.27 
 
 		 538 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  32.48 
 
 		 630 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  29.66 
 
 		 559 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  31.57 
 
 		 566 aa  153  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  30.75 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  34.55 
 
 		 622 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  29.88 
 
 		 535 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  28.88 
 
 		 559 aa  150  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  26.89 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  28.29 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  30.6 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  26.59 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  26.24 
 
 		 546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  29.91 
 
 		 534 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  30.22 
 
 		 532 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  31.4 
 
 		 578 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  25.08 
 
 		 816 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  29.55 
 
 		 568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>