More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1895 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  100 
 
 		 498 aa  972    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  63.84 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  61.52 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  60.71 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  59.4 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  52.6 
 
 		 518 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  54.34 
 
 		 490 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  53.89 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  42.13 
 
 		 538 aa  359  7e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  41.96 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  40 
 
 		 485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  38.76 
 
 		 481 aa  309  9e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  36.63 
 
 		 505 aa  302  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  37.66 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  32.97 
 
 		 468 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  33.98 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  33.4 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  32.99 
 
 		 500 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 455 aa  216  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.01 
 
 		 462 aa  216  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 460 aa  206  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.06 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 462 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.49 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  30.56 
 
 		 463 aa  170  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.31 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 448 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 453 aa  159  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 453 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 469 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 469 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 452 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.2 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.2 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.2 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.41 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  30.43 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 461 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.2 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.2 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.98 
 
 		 469 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 521 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.55 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 464 aa  136  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 475 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 462 aa  133  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>