More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1710 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  76.33 
 
 
439 aa  660    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  89.61 
 
 
433 aa  751    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
433 aa  865    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  76.92 
 
 
436 aa  671    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  69 
 
 
449 aa  604  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  48.24 
 
 
413 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  46.95 
 
 
436 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2447  GTP-binding proten HflX  43.79 
 
 
469 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  38.75 
 
 
424 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  37.5 
 
 
597 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  37.26 
 
 
597 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  37.44 
 
 
437 aa  209  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  38.15 
 
 
434 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  37.99 
 
 
431 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.46 
 
 
433 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  35.43 
 
 
405 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.22 
 
 
433 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  40.15 
 
 
434 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  37.28 
 
 
582 aa  202  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  38.14 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  37.75 
 
 
371 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  37.74 
 
 
433 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  33.99 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  37.94 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  34.62 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  34.89 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  38.5 
 
 
421 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  34.48 
 
 
419 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  33.99 
 
 
419 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  34.19 
 
 
419 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  34.24 
 
 
419 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  34.19 
 
 
419 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  34.98 
 
 
425 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  37.29 
 
 
385 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  34.41 
 
 
419 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  36.71 
 
 
395 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  36.89 
 
 
441 aa  193  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  33.99 
 
 
419 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.91 
 
 
493 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  36.1 
 
 
413 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  38.56 
 
 
442 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  36.64 
 
 
372 aa  192  9e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  34.24 
 
 
419 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  35.82 
 
 
474 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  36.32 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  35.18 
 
 
437 aa  190  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  36.77 
 
 
403 aa  190  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  35.92 
 
 
436 aa  190  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  37.36 
 
 
381 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  36.57 
 
 
409 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  36.75 
 
 
440 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  35.05 
 
 
494 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  38.07 
 
 
509 aa  186  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  36.76 
 
 
503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2100  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.14 
 
 
411 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  37.22 
 
 
412 aa  184  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  37.84 
 
 
434 aa  183  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  35.56 
 
 
426 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  35.73 
 
 
444 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  35.08 
 
 
426 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  38.9 
 
 
426 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.66 
 
 
487 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  35.32 
 
 
426 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  35.32 
 
 
426 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  35.32 
 
 
426 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  38.63 
 
 
426 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  35.32 
 
 
426 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  34.15 
 
 
415 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  33.59 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  38.59 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  36.34 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  35.88 
 
 
450 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  35.68 
 
 
372 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  39.01 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  40.06 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2080  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.53 
 
 
414 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  37.57 
 
 
428 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  37.57 
 
 
428 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  36.48 
 
 
522 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  37.85 
 
 
429 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  34.84 
 
 
426 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  34.26 
 
 
421 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  34.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  38.33 
 
 
426 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  37.57 
 
 
428 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  38.31 
 
 
435 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  37.39 
 
 
395 aa  177  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  35.99 
 
 
454 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  39.75 
 
 
433 aa  177  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  35.99 
 
 
454 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  37.85 
 
 
479 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  39.72 
 
 
432 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  37.67 
 
 
439 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>