157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1568 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  89.71 
 
 		 243 aa  434  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  77.54 
 
 		 237 aa  340  9e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  68.47 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  73.3 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  55.28 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  48.19 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  39.78 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  40.43 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  40.31 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  42.47 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  39.59 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  39.78 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  39 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  39 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  39.25 
 
 		 213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  38.92 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  37.5 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  38.5 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  40.32 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  38 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  37.84 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.77 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  37.5 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  39.04 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  38.59 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 		 202 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.41 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.11 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  34.95 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.75 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  33.87 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  34.57 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  34.24 
 
 		 203 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.6 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  30.3 
 
 		 301 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  31.03 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  32.07 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.7 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  33.9 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  28.34 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  29.22 
 
 		 297 aa  85.9  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  31.98 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  29.63 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  28.77 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.04 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  29.73 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  27.86 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  27.92 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  27.92 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  28.99 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  27.41 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  27.41 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  26.17 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  26.46 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.83 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  31.35 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  31.63 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  27.88 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  29.26 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  28.09 
 
 		 213 aa  72  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  26.34 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.32 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  25 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  26.97 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  28.92 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  28.5 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  27.03 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  30.65 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  27.45 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  26.07 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.82 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  26.87 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  23.96 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  28.65 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  26.82 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  29.94 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  26.82 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  24.19 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  26.78 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  25.14 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  27.93 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  28.4 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  26.63 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  26.02 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  26.57 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  27.53 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  28.95 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  24.56 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  27.72 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  24.43 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  23.53 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  26.01 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  24.54 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  29 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  26.88 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  28 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  28.26 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  23.58 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>