More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1392 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  74.83 
 
 
280 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  66.91 
 
 
258 aa  355  5e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  72.95 
 
 
258 aa  346  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  44.77 
 
 
260 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  44.96 
 
 
231 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  30.83 
 
 
256 aa  105  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 
245 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 
216 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 
227 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 
216 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  35.77 
 
 
223 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  50.41 
 
 
235 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  31.3 
 
 
234 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
209 aa  102  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 
226 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 
216 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  31.82 
 
 
213 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  33.46 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  50.46 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  35.43 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  33.06 
 
 
216 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  29.8 
 
 
217 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  36.42 
 
 
227 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 
210 aa  96.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  37.86 
 
 
212 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  30.19 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  34.44 
 
 
215 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  30.71 
 
 
215 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 
215 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 
247 aa  92  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  31.69 
 
 
244 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  30.24 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  31.21 
 
 
215 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  38.69 
 
 
224 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  36.11 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
213 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  45.63 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  29.92 
 
 
213 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  43.12 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  31.15 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 
195 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  36.11 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0222  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  36.11 
 
 
223 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  39.52 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  29.02 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
215 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 
211 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  33.18 
 
 
202 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  40.82 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  34.48 
 
 
223 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  42.59 
 
 
210 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 
210 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 
210 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  40.57 
 
 
212 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  33.17 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  33.17 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  31.67 
 
 
216 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  38.41 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  41.51 
 
 
213 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 
220 aa  86.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  33.17 
 
 
223 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 
192 aa  85.9  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  41.84 
 
 
215 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 
222 aa  85.9  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  34.38 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  41.35 
 
 
212 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  39.85 
 
 
197 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  23.79 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.09 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  42.65 
 
 
211 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  40.44 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  35.97 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  27.44 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>