More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1341 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1196 aa  2346    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  63.55 
 
 		 1193 aa  1387    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  42.75 
 
 		 1175 aa  852    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  66.56 
 
 		 1188 aa  1498    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  68.25 
 
 		 1192 aa  1489    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  42.26 
 
 		 1174 aa  849    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  36.24 
 
 		 1147 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  86.66 
 
 		 1189 aa  1936    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  40.22 
 
 		 1171 aa  736    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 		 1146 aa  629  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  34.16 
 
 		 1146 aa  623  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  34.75 
 
 		 1146 aa  622  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1190 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  34.2 
 
 		 1198 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  31.96 
 
 		 1219 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  34.32 
 
 		 1149 aa  566  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  31.71 
 
 		 1226 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  31.95 
 
 		 1226 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  31.32 
 
 		 1208 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  31.93 
 
 		 1184 aa  540  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  32.33 
 
 		 1217 aa  542  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  31.12 
 
 		 1196 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.38 
 
 		 1196 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.3 
 
 		 1196 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.43 
 
 		 1194 aa  489  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.91 
 
 		 1207 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1204 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  31.02 
 
 		 1201 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  30.64 
 
 		 1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  30.66 
 
 		 1189 aa  459  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  30.68 
 
 		 1183 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 		 1189 aa  459  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  29.51 
 
 		 1191 aa  458  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  31.1 
 
 		 1189 aa  452  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  31.57 
 
 		 1202 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  30.36 
 
 		 1172 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 		 1185 aa  399  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1187 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 		 1191 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.15 
 
 		 1189 aa  362  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1188 aa  357  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1188 aa  357  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.86 
 
 		 1185 aa  353  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.8 
 
 		 1187 aa  347  8e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1184 aa  341  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.72 
 
 		 1190 aa  335  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1175 aa  335  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.02 
 
 		 1196 aa  334  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.38 
 
 		 1189 aa  334  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.35 
 
 		 1189 aa  332  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  26.23 
 
 		 1189 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 		 1189 aa  326  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.71 
 
 		 1189 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 		 1185 aa  326  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  26.69 
 
 		 1191 aa  325  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 		 1181 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.65 
 
 		 1189 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 		 1189 aa  322  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 		 1189 aa  322  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.99 
 
 		 1187 aa  321  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 		 1189 aa  321  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.57 
 
 		 1189 aa  321  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  26.22 
 
 		 1186 aa  319  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 		 1170 aa  319  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 		 1174 aa  318  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.14 
 
 		 1179 aa  318  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  27.92 
 
 		 1174 aa  318  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1170 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.29 
 
 		 1184 aa  315  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.95 
 
 		 1174 aa  307  7e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.02 
 
 		 1185 aa  307  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 		 1164 aa  304  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.78 
 
 		 1186 aa  303  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  25.83 
 
 		 1177 aa  302  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  27.87 
 
 		 1187 aa  301  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1198 aa  300  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  26.25 
 
 		 1180 aa  300  9e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.77 
 
 		 1190 aa  298  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 		 1177 aa  292  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  26.06 
 
 		 1476 aa  291  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  26.86 
 
 		 1199 aa  290  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.78 
 
 		 1199 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  26.83 
 
 		 1199 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.13 
 
 		 1171 aa  286  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  29.68 
 
 		 1148 aa  285  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.26 
 
 		 1204 aa  283  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 		 1148 aa  279  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1167 aa  278  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  24.96 
 
 		 1172 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  25.32 
 
 		 1173 aa  275  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  26.49 
 
 		 1176 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  25.16 
 
 		 1179 aa  273  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  25.59 
 
 		 1168 aa  273  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  24.24 
 
 		 1169 aa  271  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  24.16 
 
 		 1169 aa  269  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.23 
 
 		 1082 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  25.84 
 
 		 1167 aa  265  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  23.99 
 
 		 1178 aa  263  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  24.98 
 
 		 1176 aa  261  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  25.87 
 
 		 1176 aa  261  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>