More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1192 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  84.82 
 
 		 257 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  65.91 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  64.12 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  63.22 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.95 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.86 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.99 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.05 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.87 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.98 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25.81 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.93 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.47 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.91 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.6 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.73 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.89 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  30.46 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.67 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  29.94 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  29.27 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  31.13 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.48 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  22.9 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  22.9 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  31.13 
 
 		 356 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 368 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.86 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 366 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  34.72 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  28.28 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.22 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  28.93 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  26.52 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  20.35 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  28.69 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  22.75 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  26.52 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  26.09 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  26.09 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>