136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1076 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  100 
 
 
327 aa  679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  48.68 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  47.52 
 
 
313 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 
336 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  45.64 
 
 
305 aa  288  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  47.35 
 
 
323 aa  287  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  46.33 
 
 
305 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  46.86 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  46.18 
 
 
307 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 
306 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  44.52 
 
 
301 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
298 aa  278  8e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  45.42 
 
 
315 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 
298 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  42.9 
 
 
312 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
303 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 
283 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
319 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  38.7 
 
 
308 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 
300 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 
296 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 
302 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  43.36 
 
 
309 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  39.73 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 
320 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 
320 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  44.06 
 
 
326 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 
319 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 
303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  39.16 
 
 
344 aa  220  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 
286 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  38.41 
 
 
286 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  36.99 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  35.56 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 
295 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  36.9 
 
 
287 aa  208  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 
296 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 
355 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  35.69 
 
 
372 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 
371 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  35.39 
 
 
345 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 
373 aa  175  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 
331 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 
373 aa  169  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.86 
 
 
326 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  32.13 
 
 
293 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 
374 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  25.67 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 
337 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  30.99 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  24.71 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 
332 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
280 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.36 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 
342 aa  52.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  21.4 
 
 
351 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 
336 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  22.1 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.26 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.68 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
405 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  36.17 
 
 
360 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.54 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  25.53 
 
 
332 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.54 
 
 
242 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.68 
 
 
235 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>