28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0965 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  94.19 
 
 		 178 aa  306  9e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  86.05 
 
 		 174 aa  284  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  81.87 
 
 		 179 aa  267  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  81.87 
 
 		 174 aa  266  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  46.5 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  44.38 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  40.48 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  42.59 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.64 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.53 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.75 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  36.69 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  36.31 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  35.5 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  34.73 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  34.91 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  38.24 
 
 		 211 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.96 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  35.37 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  30.95 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.33 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.52 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.4 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.76 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  25.76 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  28.24 
 
 		 795 aa  42  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.36 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>