More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0924 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  62.41 
 
 
598 aa  678    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
626 aa  1243    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  49.44 
 
 
576 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  43.01 
 
 
584 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.7 
 
 
570 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  46.02 
 
 
576 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  40.46 
 
 
582 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  43.99 
 
 
575 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.8 
 
 
644 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.82 
 
 
638 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  43.37 
 
 
609 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.13 
 
 
627 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.28 
 
 
608 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.74 
 
 
646 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.71 
 
 
589 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  41.76 
 
 
646 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.7 
 
 
648 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.64 
 
 
648 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.7 
 
 
648 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.52 
 
 
623 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  41.83 
 
 
598 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.28 
 
 
621 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.31 
 
 
562 aa  365  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.52 
 
 
643 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.63 
 
 
598 aa  365  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.52 
 
 
546 aa  363  4e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.91 
 
 
543 aa  362  8e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.78 
 
 
540 aa  361  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.61 
 
 
542 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.07 
 
 
646 aa  361  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.83 
 
 
552 aa  360  6e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  40.07 
 
 
641 aa  357  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.16 
 
 
644 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.33 
 
 
539 aa  355  2e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.52 
 
 
539 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  41.49 
 
 
633 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42 
 
 
637 aa  349  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.67 
 
 
566 aa  348  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.83 
 
 
637 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.07 
 
 
566 aa  345  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.02 
 
 
681 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.7 
 
 
542 aa  342  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.48 
 
 
539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.37 
 
 
568 aa  333  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.07 
 
 
567 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.1 
 
 
680 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.45 
 
 
567 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  35.64 
 
 
568 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.08 
 
 
566 aa  323  8e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.26 
 
 
601 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  38.06 
 
 
601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.06 
 
 
601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.41 
 
 
575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  36.96 
 
 
596 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.22 
 
 
605 aa  320  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.46 
 
 
605 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  41.06 
 
 
630 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 
605 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.46 
 
 
605 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.18 
 
 
596 aa  318  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  37.69 
 
 
567 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.08 
 
 
596 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.84 
 
 
596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  37.39 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  36.2 
 
 
638 aa  314  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  38.78 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.66 
 
 
592 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.33 
 
 
578 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
575 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  36.99 
 
 
594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  38.78 
 
 
567 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.02 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.23 
 
 
575 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
592 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
592 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
592 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.39 
 
 
592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.09 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.33 
 
 
567 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.09 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.03 
 
 
575 aa  310  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.03 
 
 
575 aa  310  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.31 
 
 
592 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.01 
 
 
595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29304  predicted protein  37.54 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.07 
 
 
567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.09 
 
 
591 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.43 
 
 
567 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.67 
 
 
608 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.16 
 
 
601 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 
591 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>