More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0805 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 		 361 aa  731    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  76.92 
 
 		 365 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  68.79 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  69.6 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  66.76 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  44.88 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  47.13 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  44.76 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  42.41 
 
 		 363 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  44.84 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  41.09 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  40.56 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  40.96 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  40.68 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  39.3 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  39.83 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  38.87 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  39.03 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.99 
 
 		 403 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.95 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.72 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.92 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.96 
 
 		 498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.87 
 
 		 468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.96 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.69 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.64 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  29.64 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  30.06 
 
 		 532 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.74 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  27.69 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.83 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.68 
 
 		 478 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  28.96 
 
 		 572 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.51 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.69 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.25 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  31.64 
 
 		 548 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  31.47 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  28.91 
 
 		 460 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.15 
 
 		 498 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.67 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  28.46 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  27.71 
 
 		 515 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  31.2 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  31.2 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  31.87 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.96 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  30.8 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.83 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  30.71 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  31.6 
 
 		 498 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.92 
 
 		 560 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  31.6 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  31.6 
 
 		 473 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.69 
 
 		 475 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.76 
 
 		 464 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  26.78 
 
 		 398 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  24.61 
 
 		 464 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.1 
 
 		 516 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  29.87 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  33.73 
 
 		 483 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  28.07 
 
 		 468 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.57 
 
 		 549 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  29.45 
 
 		 548 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.76 
 
 		 546 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  29.44 
 
 		 466 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  27.7 
 
 		 605 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  27.98 
 
 		 605 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.18 
 
 		 552 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0149  glutamate decarboxylase  25.86 
 
 		 496 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.283505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.4 
 
 		 549 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.4 
 
 		 549 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.21 
 
 		 549 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.4 
 
 		 549 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03700  glutamate decarboxylase, putative  28.12 
 
 		 557 aa  92.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03700  glutamate decarboxylase, putative  28.12 
 
 		 557 aa  92.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2217  predicted protein  25.47 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  30.15 
 
 		 548 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.84 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.84 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.02 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.85 
 
 		 552 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  27.63 
 
 		 533 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.69 
 
 		 546 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.22 
 
 		 548 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  28.22 
 
 		 484 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.76 
 
 		 550 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  24.17 
 
 		 466 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  29.77 
 
 		 552 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.63 
 
 		 789 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  26.94 
 
 		 543 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.37 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.95 
 
 		 461 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40180  Glutamate decarboxylase (GAD) (ERT D1)  25.09 
 
 		 569 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  29.26 
 
 		 511 aa  88.6  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  27 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  30.04 
 
 		 544 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  27 
 
 		 461 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>