More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0744 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  100 
 
 
537 aa  1078    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  59.35 
 
 
549 aa  620  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  46.59 
 
 
546 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  45.98 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  46.69 
 
 
529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  34.08 
 
 
484 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  33.94 
 
 
485 aa  230  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  32.19 
 
 
507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  31.09 
 
 
486 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  28.93 
 
 
566 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  32.2 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 
388 aa  172  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  33.07 
 
 
388 aa  170  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  32.37 
 
 
388 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  31.99 
 
 
391 aa  162  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  34.46 
 
 
564 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  23.88 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  27.32 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  23.73 
 
 
525 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  27.59 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  23.9 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  29.73 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  24.75 
 
 
534 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  23.95 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  31.65 
 
 
495 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  23.84 
 
 
535 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  27.01 
 
 
445 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  30.04 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  23.32 
 
 
843 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  25.75 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  23.19 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.65 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  23.26 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  30.12 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  23.85 
 
 
533 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  26.1 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  23.47 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  23.44 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  31.85 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  23.26 
 
 
535 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  23.55 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  24.94 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.28 
 
 
594 aa  67  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  23.66 
 
 
526 aa  67  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.17 
 
 
533 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  24.3 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  27.86 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  23.96 
 
 
410 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  22.85 
 
 
512 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  28.51 
 
 
464 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.18 
 
 
853 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  30.77 
 
 
461 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  26.86 
 
 
613 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  27.31 
 
 
613 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  28.86 
 
 
531 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  25.49 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  28.79 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  28.18 
 
 
474 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  22.56 
 
 
761 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  27.31 
 
 
613 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  25.61 
 
 
406 aa  65.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  23.26 
 
 
399 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.45 
 
 
848 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  24.2 
 
 
532 aa  64.3  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  22.83 
 
 
532 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  25.64 
 
 
521 aa  63.9  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  23.35 
 
 
533 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.99 
 
 
554 aa  63.9  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  23.77 
 
 
638 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  22.38 
 
 
532 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  27.3 
 
 
489 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  27.39 
 
 
566 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  22.55 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  26.02 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 
521 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  22.96 
 
 
496 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  25.25 
 
 
622 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  24.34 
 
 
554 aa  62  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  26.61 
 
 
537 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  24.19 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  22.89 
 
 
496 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  25.93 
 
 
605 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  25.25 
 
 
622 aa  61.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.29 
 
 
849 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  24.67 
 
 
554 aa  61.6  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  23.48 
 
 
416 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  24.32 
 
 
532 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  24.64 
 
 
554 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  22.39 
 
 
530 aa  60.1  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  24.81 
 
 
740 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  27.02 
 
 
595 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  25.88 
 
 
603 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  24.12 
 
 
532 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.45 
 
 
607 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  26.3 
 
 
529 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  27.95 
 
 
532 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  21.53 
 
 
622 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>