More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0569 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  100 
 
 
295 aa  569  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2964  PfkB domain protein  64.26 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.330402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  51.57 
 
 
289 aa  246  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  47.85 
 
 
387 aa  219  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
305 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  36.49 
 
 
304 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  35.59 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.78 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 
305 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  32.57 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  31.61 
 
 
305 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.72 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.61 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.61 
 
 
307 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  30.98 
 
 
295 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  33.44 
 
 
309 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 
302 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 
302 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  30.19 
 
 
311 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.61 
 
 
309 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 
290 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.41 
 
 
302 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  24 
 
 
302 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  33.33 
 
 
305 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  28.52 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  34.55 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  30.1 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.86 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  32.79 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  31.05 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  31.05 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  31.05 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  31.05 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  31.05 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  31.15 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  31.13 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  31.15 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  31.15 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.06 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.21 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.48 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  31.07 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.27 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.59 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  27.3 
 
 
345 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  32.89 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.3 
 
 
323 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.1 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  30.13 
 
 
303 aa  92.4  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  29.18 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.45 
 
 
317 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.24 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  30.2 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  27.97 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.99 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  26.27 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  30.64 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  29.18 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  29.18 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  29.93 
 
 
645 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  28.96 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25.25 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  29.18 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  26.92 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.67 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  25.75 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.19 
 
 
317 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27.08 
 
 
298 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  28.85 
 
 
314 aa  89  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.72 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.74 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  28.57 
 
 
305 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  26.71 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  27.08 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  27.08 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  29.67 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  26 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  26.74 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  27.33 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  26.88 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.74 
 
 
298 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  35.31 
 
 
283 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.21 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.38 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  24.74 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  27.21 
 
 
298 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  30.77 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  28.85 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.93 
 
 
329 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.23 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25.69 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>