62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0506 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 583 aa  1164    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  51.27 
 
 		 546 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  52.53 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  46.94 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  43.47 
 
 		 477 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 482 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  25.93 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  32.57 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.31 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 471 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 478 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 506 aa  55.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 476 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 488 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  24.19 
 
 		 466 aa  54.7  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  41.25 
 
 		 464 aa  54.3  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 433 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  28.97 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 475 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  29.21 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 468 aa  51.2  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 489 aa  51.2  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 413 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  23.94 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 500 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0053  hypothetical protein  62.86 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.994016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.72 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1759  hypothetical protein  35 
 
 		 335 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0247537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 529 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 479 aa  47.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  22.32 
 
 		 431 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2131  hypothetical protein  57.14 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 486 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 490 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  29.17 
 
 		 490 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  26.82 
 
 		 461 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  26.75 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>