123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0488 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0488  protein of unknown function DUF198  100 
 
 
310 aa  632  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2853  protein of unknown function DUF198  92.9 
 
 
310 aa  594  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2276  GTP cyclohydrolase  79.74 
 
 
309 aa  502  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.593749  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1583  GTP cyclohydrolase  75.4 
 
 
309 aa  480  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2260  GTP cyclohydrolase  75.4 
 
 
340 aa  474  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0480  GTP cyclohydrolase  47.28 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1183  GTP cyclohydrolase  46.79 
 
 
319 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0355  GTP cyclohydrolase  48.05 
 
 
322 aa  294  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.498467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2173  GTP cyclohydrolase  46.25 
 
 
313 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0018  GTP cyclohydrolase  45.13 
 
 
311 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0083  GTP cyclohydrolase  45.48 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0054  GTP cyclohydrolase  47.27 
 
 
317 aa  288  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2334  GTP cyclohydrolase  44.27 
 
 
328 aa  288  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.163269  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1148  GTP cyclohydrolase  42.62 
 
 
309 aa  253  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.713445  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1031  GTP cyclohydrolase  41.1 
 
 
312 aa  238  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.489752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0915  GTP cyclohydrolase  42.07 
 
 
315 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.599141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1031  GTP cyclohydrolase  41.42 
 
 
315 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.59743  hitchhiker  0.00756508 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1646  GTP cyclohydrolase  41.75 
 
 
315 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.333029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5367  protein of unknown function DUF198  39.61 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0781  protein of unknown function DUF198  35.12 
 
 
290 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.783967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0579  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
480 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3074  putative GTP cyclohydrolase  26.42 
 
 
261 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0544454  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2039  hypothetical protein  27.84 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.868554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0878  GTP cyclohydrolase  28.23 
 
 
269 aa  92.4  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76872  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1973  conserved hypothetical protein TIGR00294  27.55 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1641  protein of unknown function DUF198  27.55 
 
 
264 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0484  putative GTP cyclohydrolase  26.73 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2826  putative GTP cyclohydrolase  27.7 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0830  hypothetical protein  26.1 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3787  putative GTP cyclohydrolase  25.61 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0489  GTP cyclohydrolase  29.01 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427836  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1703  hypothetical protein  30.23 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0883  putative GTP cyclohydrolase  28.67 
 
 
270 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1052  protein of unknown function DUF198  28.52 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0944  putative GTP cyclohydrolase  29.15 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6780  putative GTP cyclohydrolase  27.7 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849591  hitchhiker  0.000971537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1773  putative GTP cyclohydrolase  27.05 
 
 
269 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4045  putative GTP cyclohydrolase  26.19 
 
 
285 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.96035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3692  putative GTP cyclohydrolase  25.26 
 
 
267 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1766  GTP cyclohydrolase  25.68 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1421  protein of unknown function DUF198  29.7 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2614  putative GTP cyclohydrolase  27.8 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.307548  normal  0.812477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2134  GTP cyclohydrolase  26.99 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000813269  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1986  putative GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0615  putative GTP cyclohydrolase  25.67 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0531  hypothetical protein  24.66 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3947  putative GTP cyclohydrolase  26.8 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3062  GTP cyclohydrolase  24.24 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000921807  unclonable  0.000000032257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0589  putative GTP cyclohydrolase  25.75 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0603  putative GTP cyclohydrolase  25.75 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0093  protein of unknown function DUF198  27.46 
 
 
264 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1681  protein of unknown function DUF198  28.14 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3777  putative GTP cyclohydrolase  26.46 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730227  normal  0.0392269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0457  putative GTP cyclohydrolase  23.78 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0884  putative GTP cyclohydrolase  26.03 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.310056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2210  putative GTP cyclohydrolase  25.61 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4819  putative GTP cyclohydrolase  25.61 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765957  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3251  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0906  putative GTP cyclohydrolase  26.03 
 
 
259 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.131356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1321  putative GTP cyclohydrolase  29.43 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0144328 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1766  putative GTP cyclohydrolase  26.96 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0237  hypothetical protein  26.87 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.703325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4485  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3880  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.141532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3647  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0615  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0331  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0841  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1514  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1707  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2533  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2391  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.075557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0366  putative GTP cyclohydrolase  26.12 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2318  hypothetical protein  24.39 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3275  putative GTP cyclohydrolase  23.47 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3230  putative GTP cyclohydrolase  26.37 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0212  putative GTP cyclohydrolase  24.16 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2220  putative GTP cyclohydrolase  24.05 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0473  putative GTP cyclohydrolase  27.4 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2032  putative GTP cyclohydrolase  23.37 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.527904  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2425  putative GTP cyclohydrolase  23.71 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0209  putative GTP cyclohydrolase  27.3 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2981  putative GTP cyclohydrolase  23.97 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0301  putative GTP cyclohydrolase  23.55 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.624443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4100  hypothetical protein  23.88 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1875  putative GTP cyclohydrolase  23.61 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2628  putative GTP cyclohydrolase  27.54 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.10548  normal  0.526872 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0620  hypothetical protein  26.58 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00138013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0441  putative GTP cyclohydrolase  23.21 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4498  putative GTP cyclohydrolase  21.64 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2224  hypothetical protein  24.58 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2957  putative GTP cyclohydrolase  25.35 
 
 
256 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1099  putative GTP cyclohydrolase  26.95 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2630  GTP cyclohydrolase  24.38 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0272371  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2312  GTP cyclohydrolase I  26.85 
 
 
359 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0317  putative GTP cyclohydrolase  28.71 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0923  putative GTP cyclohydrolase  22.51 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134709  normal  0.123091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2411  putative GTP cyclohydrolase  23.55 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.556277  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1852  putative GTP cyclohydrolase  25.93 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0501  putative GTP cyclohydrolase  25.93 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>