More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0304 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0304  transport system permease protein  100 
 
 
369 aa  715    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  63.81 
 
 
376 aa  465  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2443  transport system permease protein  65.38 
 
 
374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2192  transport system permease protein  59.3 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0539  transport system permease protein  64.53 
 
 
390 aa  401  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.692668  normal  0.940815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0395  transport system permease protein  59.26 
 
 
311 aa  278  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.79 
 
 
345 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 
325 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
342 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
342 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  38.79 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  38.79 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  38.79 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  38.79 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  37.63 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4373  transport system permease protein  37.94 
 
 
327 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  37.28 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  37.28 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  37.28 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  41.07 
 
 
345 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.57 
 
 
326 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
327 aa  186  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.81 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.04 
 
 
367 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.97 
 
 
337 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.78 
 
 
678 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  36.82 
 
 
328 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  36.23 
 
 
328 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  38.13 
 
 
346 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.78 
 
 
678 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.78 
 
 
678 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  39.19 
 
 
340 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.78 
 
 
678 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.78 
 
 
678 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  38.13 
 
 
346 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.78 
 
 
678 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  39.72 
 
 
368 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.43 
 
 
678 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.43 
 
 
352 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.73 
 
 
348 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  33.87 
 
 
362 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  32.5 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.32 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.73 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.96 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  41.01 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.39 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  35.38 
 
 
333 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  31.29 
 
 
350 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  39.3 
 
 
325 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.17 
 
 
350 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  36.21 
 
 
315 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.49 
 
 
452 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  35.1 
 
 
329 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  32.29 
 
 
338 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.32 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  36.43 
 
 
334 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  39.93 
 
 
340 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.23 
 
 
319 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  35.49 
 
 
345 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  37.1 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  34.97 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.28 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.92 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  35.11 
 
 
334 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  35.99 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  35.11 
 
 
334 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  35.99 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  35.11 
 
 
334 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  35.99 
 
 
338 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  40.5 
 
 
346 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  33.13 
 
 
347 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  36.33 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  36.46 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.56 
 
 
337 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  36.33 
 
 
338 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  36.75 
 
 
333 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
343 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.91 
 
 
358 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  34.74 
 
 
343 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  39.14 
 
 
352 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  35.4 
 
 
340 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.22 
 
 
337 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  35.52 
 
 
336 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>