268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0210 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
397 aa  781    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  51.7 
 
 
436 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
963 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  29.4 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  21.31 
 
 
445 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  26.62 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 
795 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
687 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 
432 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  29.66 
 
 
475 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 
431 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  27.12 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 
774 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 
652 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24 
 
 
653 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.47 
 
 
1454 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
611 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.26 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  28.92 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.45 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.79 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.47 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  27.62 
 
 
1812 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  29.84 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.82 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.82 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.5 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  20.64 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.82 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.07 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  25.22 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.54 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.83 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.49 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  25.22 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  24.19 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.84 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.51 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.51 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
619 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2891  putative lipoprotein  24.78 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  22.22 
 
 
1009 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.79 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.22 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 
705 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  29.07 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
861 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  24.49 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.7 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.07 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  31.53 
 
 
901 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.66 
 
 
1682 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  25.37 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.74 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  25.18 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1803  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.325377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  25.87 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  26.09 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.11 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  26.55 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.83 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.67 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.71 
 
 
448 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.56 
 
 
1328 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  26.33 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.24 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.86 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.33 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  25.54 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.57 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.6 
 
 
1969 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.39 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  25.27 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.57 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.22 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  21.93 
 
 
616 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.21 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.6 
 
 
2036 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.42 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.78 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
643 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 
834 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>