23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0159 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  100 
 
 
360 aa  721    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  71.54 
 
 
427 aa  536  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  62.15 
 
 
361 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  65.08 
 
 
362 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  42.93 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  35.12 
 
 
364 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  37.94 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  34.8 
 
 
413 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  31.74 
 
 
354 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  35.19 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  33.53 
 
 
338 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  33.63 
 
 
362 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  30.77 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  36.32 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  28.7 
 
 
356 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  26.8 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  29.89 
 
 
346 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  34.55 
 
 
349 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  35.68 
 
 
349 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  32.46 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  19.71 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01730  hypothetical protein  32.29 
 
 
502 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00260  Subunit of DNA primase (Eurofung)  25.77 
 
 
500 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0283839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>