More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0030 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  49.64 
 
 		 293 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  50.35 
 
 		 295 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  49.64 
 
 		 294 aa  291  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  46.43 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  48.93 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  47.16 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  46.43 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  46.43 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  47.69 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  48.23 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  45.74 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  45.74 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  46.43 
 
 		 319 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  45.74 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  45.36 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  43.16 
 
 		 295 aa  246  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  41.15 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.49 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  36.49 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  36.14 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  36.14 
 
 		 307 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  36.14 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  33.33 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  35.54 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  33.22 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.74 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.58 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  28.93 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  28.51 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.21 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  25.98 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  27.1 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  25.67 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  25.2 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  22.89 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.19 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  24.9 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  23.97 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.2 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  27.38 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 238 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  26.03 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.02 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.38 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.21 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  26.1 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  25.4 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  23.75 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.89 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.81 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.94 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25.81 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>