122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0012 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  44.28 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  26.83 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 270 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  23.61 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>