90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0006 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  34.88 
 
 
297 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
297 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  31.99 
 
 
296 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  31.7 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  35.08 
 
 
289 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
301 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  32.61 
 
 
358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  30.47 
 
 
311 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
308 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  28.57 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  30.33 
 
 
884 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
271 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.38 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.27 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.27 
 
 
385 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.36 
 
 
341 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  30.71 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  27.64 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.13 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  25.42 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.41 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
276 aa  62.4  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.12 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  26.25 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  26.29 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.39 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  24.86 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  27.19 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.94 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.24 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
338 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  25.37 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  23.56 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.48 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  23.16 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  25.85 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  30.57 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  22.8 
 
 
278 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
287 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.88 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
373 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  31.65 
 
 
355 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0887  putative mannonate dehydratase  22.38 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
268 aa  42.7  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  24 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
293 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  26.37 
 
 
323 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>