268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0068 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_R0068  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.73811e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0042  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 116 bp  230  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.488998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0024  5S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 117 bp  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0054  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000257756  decreased coverage  0.000469584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0028  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0420198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0018  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0005  5S ribosomal RNA  95.45 
 
 		 117 bp  107  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  97.6  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 114 bp  97.6  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0016  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 117 bp  93.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0005  5S ribosomal RNA  86.87 
 
 		 117 bp  93.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.52738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0026  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0040  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0031  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0107699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0061  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0058  5S ribosomal RNA  85.84 
 
 		 115 bp  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000489313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 115 bp  87.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0106  5S ribosomal RNA  90.91 
 
 		 116 bp  83.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0042  5S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 117 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0028  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0068  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0041  5S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0067  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0025  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0071  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0020  5S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 116 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0021  5S ribosomal RNA  83.93 
 
 		 117 bp  79.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.125284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0005  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0018  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0020  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0033  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0049  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0052  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0076  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0092  5S ribosomal RNA  88 
 
 		 117 bp  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.214269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0004  5S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0028  5S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 116 bp  75.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.348714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0005  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.493215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0063  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00852672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0017  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00334647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0012  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0031  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0060  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0055  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0028  5S ribosomal RNA  88.24 
 
 		 116 bp  71.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000903183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0048  5S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0053  5S ribosomal RNA  82.88 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0282002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  88.06 
 
 		 117 bp  69.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  86.08 
 
 		 114 bp  69.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0042  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0030  5S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539781  decreased coverage  0.000469823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0045  5S ribosomal RNA  86.36 
 
 		 112 bp  67.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0024  5S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0017  5S ribosomal RNA  85.37 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0043  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0044  5S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.834046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0034  5S ribosomal RNA  83.02 
 
 		 117 bp  67.9  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.263469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0029  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0048  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000922958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0031  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00046496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0009  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0053  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 119 bp  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.545293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0656  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 36 bp  65.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.757563  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1370  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 36 bp  65.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0008  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 110 bp  61.9  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0171823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0022  5S ribosomal RNA  84.81 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0024  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 122 bp  61.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0025  5S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 118 bp  61.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0029  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.759375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  82.08 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0003  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0189262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0032  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.113834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0011  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0051  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0058  5S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 116 bp  60  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0779086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0027  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 205 bp  60  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.866898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0059  5S ribosomal RNA  88.89 
 
 		 205 bp  60  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  96.97 
 
 		 115 bp  58  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0021  5S ribosomal RNA  81.42 
 
 		 116 bp  58  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.080713 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0005  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185376  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0380  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 109 bp  58  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0833  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 109 bp  58  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 114 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0451  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1564  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  96.97 
 
 		 119 bp  58  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>