128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0058 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.00399e-07  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  94.59 
 
 
77 bp  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.81838e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  91.89 
 
 
76 bp  93.7  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  91.03 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  91.03 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  90.54 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.50994e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  92.19 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  95.65 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  93.88 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  93.88 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  93.88 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  3.59807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  93.88 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.71008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  94 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  93.48 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.00461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0016  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  5.14764e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  91.84 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.91538e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  89.06 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  91.49 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  91.49 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0009  tRNA-Arg  84.62 
 
 
78 bp  60  8e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.33621e-14  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  60  8e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  85.9 
 
 
77 bp  60  8e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  85.9 
 
 
79 bp  60  8e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  1e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  92.5 
 
 
79 bp  56  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  1e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  92.5 
 
 
79 bp  56  1e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.13688e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  92.5 
 
 
77 bp  56  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  93.18 
 
 
77 bp  56  1e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  54  5e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.97698e-05  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  96.77 
 
 
76 bp  54  5e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  89.36 
 
 
77 bp  54  5e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  96.77 
 
 
76 bp  54  5e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  89.36 
 
 
77 bp  54  5e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.75321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  96.77 
 
 
76 bp  54  5e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  89.36 
 
 
77 bp  54  5e-06  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  86.15 
 
 
76 bp  52  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  86.21 
 
 
75 bp  52  2e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  52  2e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  7.05596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  89.13 
 
 
76 bp  52  2e-05  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90 
 
 
74 bp  52  2e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.27256e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  94.12 
 
 
104 bp  52  2e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0024  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  52  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  92.11 
 
 
76 bp  52  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.78277e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  89.13 
 
 
80 bp  52  2e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.34564e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  6.81563e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.87168e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.38552e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  96.55 
 
 
73 bp  50.1  7e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  2.47527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  89.58 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  91.89 
 
 
75 bp  50.1  7e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  87.76 
 
 
79 bp  50.1  7e-05  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  6.31385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  86.15 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.20516e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  91.11 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  93.94 
 
 
74 bp  50.1  7e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  93.94 
 
 
77 bp  50.1  7e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  86.44 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.52331e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.38631e-09 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  86.44 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0019  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1397  tRNA-Arg  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>