More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23430 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  54.17 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 129 aa  137  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  52.07 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  53.45 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  52.17 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  50.82 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  50.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  53.23 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  52.99 
 
 		 123 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 123 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  51.26 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  47.15 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  53.39 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  46.09 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  56.25 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>