More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23200 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  100 
 
 
654 aa  1350    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  42.36 
 
 
499 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  40.83 
 
 
515 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  40.83 
 
 
509 aa  364  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  38.31 
 
 
522 aa  346  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  38 
 
 
493 aa  332  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  38.73 
 
 
595 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 
593 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  39.09 
 
 
588 aa  319  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  40.08 
 
 
545 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  39.34 
 
 
541 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  39.79 
 
 
541 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 
583 aa  308  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  37.18 
 
 
558 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  37.28 
 
 
441 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  35.82 
 
 
455 aa  269  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  37.05 
 
 
441 aa  267  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 
575 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  35.89 
 
 
555 aa  254  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  35.89 
 
 
555 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  34.21 
 
 
454 aa  253  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  32.94 
 
 
551 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  47.46 
 
 
258 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  35.68 
 
 
815 aa  243  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  32.49 
 
 
1139 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 
1138 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  31.7 
 
 
524 aa  233  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  36.04 
 
 
647 aa  233  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  30.71 
 
 
1102 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  30.53 
 
 
606 aa  231  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  31.45 
 
 
557 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.66 
 
 
1154 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.31 
 
 
1137 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.31 
 
 
1137 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  30.13 
 
 
567 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.14 
 
 
1137 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.31 
 
 
1137 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  32.75 
 
 
548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  31.06 
 
 
1100 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.7 
 
 
1093 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.66 
 
 
1154 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  30.56 
 
 
577 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  29.96 
 
 
1137 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28.71 
 
 
1152 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.73 
 
 
1131 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.73 
 
 
1131 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.73 
 
 
1131 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.73 
 
 
1131 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.73 
 
 
1131 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.28 
 
 
1121 aa  225  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  31 
 
 
1106 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  31.62 
 
 
1114 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  29.89 
 
 
556 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  30.36 
 
 
591 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  29.72 
 
 
1115 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.96 
 
 
1136 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29 
 
 
1093 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.53 
 
 
1131 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  29.2 
 
 
552 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  30 
 
 
1102 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  32.64 
 
 
551 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  30 
 
 
1102 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  32.18 
 
 
1108 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  29.75 
 
 
1106 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  29.75 
 
 
1106 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  29.17 
 
 
562 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  28.91 
 
 
1088 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.27 
 
 
1092 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  29.29 
 
 
1100 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  30.8 
 
 
1098 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  29.74 
 
 
1110 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 
541 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  29.7 
 
 
1164 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  30.49 
 
 
682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  29.7 
 
 
1164 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  30.62 
 
 
1101 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  29.98 
 
 
567 aa  217  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  31.28 
 
 
1099 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  29.48 
 
 
1105 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  29.98 
 
 
1116 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  28.8 
 
 
601 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  29.98 
 
 
1116 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  30.58 
 
 
1112 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  31.19 
 
 
572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  29.86 
 
 
1100 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  30.16 
 
 
549 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  29.63 
 
 
574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  30.94 
 
 
1100 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.62 
 
 
1088 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  31.86 
 
 
1130 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  30.65 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  29.61 
 
 
1100 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.87 
 
 
556 aa  213  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  29.09 
 
 
1088 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  29.09 
 
 
1088 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.43 
 
 
1142 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  29.4 
 
 
1160 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  30.67 
 
 
598 aa  213  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  29.46 
 
 
601 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  29.86 
 
 
1100 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>