More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22700 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  100 
 
 
501 aa  1007    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  61.66 
 
 
504 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  50.7 
 
 
514 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  50.81 
 
 
499 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  50.81 
 
 
499 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  51.11 
 
 
503 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  50.51 
 
 
496 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  49.59 
 
 
514 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  47.28 
 
 
513 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  50 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47 
 
 
524 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.97 
 
 
516 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  49.6 
 
 
503 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  48.37 
 
 
503 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  49.29 
 
 
500 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.76 
 
 
514 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.76 
 
 
514 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.97 
 
 
514 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  48.5 
 
 
518 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  51.41 
 
 
500 aa  475  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  51.02 
 
 
494 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  48.51 
 
 
505 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  46.95 
 
 
520 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  47.89 
 
 
503 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
525 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  47.15 
 
 
504 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  49.49 
 
 
501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  49.49 
 
 
501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  47.97 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  48.37 
 
 
499 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.75 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.53 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  49.69 
 
 
495 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.36 
 
 
517 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  47.56 
 
 
503 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  47.87 
 
 
496 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 
494 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
523 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.74 
 
 
499 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  49.09 
 
 
495 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
494 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  47.56 
 
 
508 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.23 
 
 
512 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.67 
 
 
506 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  48.31 
 
 
504 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  46.06 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 
515 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.62 
 
 
503 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  47.97 
 
 
495 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  46.26 
 
 
506 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  45.8 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 
506 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  48.28 
 
 
506 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  47.99 
 
 
500 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
494 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  48.39 
 
 
505 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
494 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.42 
 
 
513 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.72 
 
 
495 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 
515 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  47.65 
 
 
525 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.31 
 
 
507 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  46.41 
 
 
526 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  45.4 
 
 
499 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  47.29 
 
 
505 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  46.86 
 
 
496 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  49.11 
 
 
507 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.53 
 
 
512 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.06 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.67 
 
 
517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  46.06 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.03 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.51 
 
 
524 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.3 
 
 
524 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  45.33 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.33 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.68 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.3 
 
 
524 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  45.23 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 
502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  44.92 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.51 
 
 
524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>