More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_21840 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  59.7 
 
 
320 aa  341  8e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  60.9 
 
 
317 aa  338  8e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  55.88 
 
 
329 aa  322  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  60.53 
 
 
318 aa  319  4e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  53.48 
 
 
338 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  53.56 
 
 
327 aa  308  7e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  59.63 
 
 
323 aa  304  1e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  54.44 
 
 
322 aa  302  4e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  56.93 
 
 
316 aa  299  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  54.07 
 
 
322 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  54.28 
 
 
322 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  52.38 
 
 
334 aa  292  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  53.65 
 
 
327 aa  291  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  54.41 
 
 
319 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  51.13 
 
 
319 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  53.33 
 
 
327 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  52.59 
 
 
331 aa  283  2e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  48.88 
 
 
320 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.53458e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  52.59 
 
 
323 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.07 
 
 
332 aa  275  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  51.48 
 
 
324 aa  274  1e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  46.07 
 
 
319 aa  273  2e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.81 
 
 
326 aa  273  2e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  48.88 
 
 
348 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.79 
 
 
331 aa  271  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.9 
 
 
329 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.58591e-05  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.53 
 
 
329 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.53 
 
 
329 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  48.16 
 
 
352 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  48.16 
 
 
346 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  48.16 
 
 
346 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  48.16 
 
 
352 aa  268  6e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.16 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.16 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4216  2-hydroxyacid dehydrogenase  49.26 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243967  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  48.16 
 
 
329 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.88 
 
 
328 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.12 
 
 
331 aa  266  3e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.9 
 
 
329 aa  266  3e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  48.9 
 
 
329 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  47.83 
 
 
339 aa  265  6e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  48.53 
 
 
329 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2200  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.63 
 
 
329 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164491  normal  0.37068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  48.18 
 
 
330 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0964  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.08 
 
 
333 aa  261  7e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0906507 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.63 
 
 
329 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  48.53 
 
 
328 aa  260  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0979  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.63 
 
 
329 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.19 
 
 
335 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.97 
 
 
326 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.58 
 
 
319 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.58 
 
 
319 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0899  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.08 
 
 
333 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.600905  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  50 
 
 
317 aa  259  5e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50 
 
 
317 aa  259  5e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48 
 
 
338 aa  259  5e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.19 
 
 
326 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.19 
 
 
326 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.55 
 
 
334 aa  258  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  49.06 
 
 
329 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  50.75 
 
 
317 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  48.74 
 
 
340 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0193  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  51.74 
 
 
329 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  48.7 
 
 
318 aa  255  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2171  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  50.94 
 
 
319 aa  254  9e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  48.19 
 
 
360 aa  254  1e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.18 
 
 
326 aa  253  2e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  46.9 
 
 
357 aa  253  2e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.07 
 
 
328 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  47.64 
 
 
334 aa  252  5e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2144  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.44 
 
 
327 aa  251  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.21 
 
 
345 aa  251  8e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  46.38 
 
 
334 aa  250  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  46.72 
 
 
330 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07425e-10 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  49.08 
 
 
332 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  47.43 
 
 
328 aa  250  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2069  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.81 
 
 
338 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  hitchhiker  0.00440451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  46.74 
 
 
357 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  47.43 
 
 
328 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.61 
 
 
324 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  46.01 
 
 
333 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  46.01 
 
 
333 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  46.95 
 
 
341 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  48.85 
 
 
311 aa  248  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1622  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  47.58 
 
 
328 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.11 
 
 
324 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1034  2-hydroxyacid dehydrogenase  48.86 
 
 
334 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26075  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.73 
 
 
324 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  50.58 
 
 
321 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2446  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.89 
 
 
334 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  47.41 
 
 
328 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  52.17 
 
 
321 aa  244  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.01 
 
 
334 aa  244  1e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1137  glycerate dehydrogenase  50.18 
 
 
323 aa  244  1e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.657649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3876  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  50.18 
 
 
323 aa  243  2e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1468  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  49.82 
 
 
323 aa  243  2e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  46.67 
 
 
325 aa  243  2e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  47.29 
 
 
326 aa  243  2e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  48.45 
 
 
324 aa  242  4e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>