More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20380 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  100 
 
 
207 aa  420  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  47.6 
 
 
207 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  49.52 
 
 
216 aa  194  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50.24 
 
 
205 aa  193  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  51.22 
 
 
213 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  49.52 
 
 
225 aa  190  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  47.83 
 
 
671 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  49.5 
 
 
210 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  48.53 
 
 
212 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  48.29 
 
 
705 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.32 
 
 
217 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  50.24 
 
 
219 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  49.51 
 
 
210 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  48.54 
 
 
686 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  47.83 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.89 
 
 
203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  47.52 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  47.29 
 
 
703 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  48.79 
 
 
686 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.56 
 
 
210 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.8 
 
 
707 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.05 
 
 
688 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  48.26 
 
 
215 aa  180  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  46.34 
 
 
901 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  48.31 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.93 
 
 
233 aa  177  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  47.14 
 
 
214 aa  177  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.8 
 
 
207 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  46.63 
 
 
218 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  45.1 
 
 
216 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50.75 
 
 
207 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  45.15 
 
 
208 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  45.41 
 
 
210 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.24 
 
 
224 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  46.73 
 
 
205 aa  174  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  46.73 
 
 
205 aa  174  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  44.83 
 
 
204 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  49.47 
 
 
214 aa  174  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  46.86 
 
 
211 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  43.69 
 
 
234 aa  173  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.69 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  44.28 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.76 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.58 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  45.58 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.83 
 
 
225 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.96 
 
 
688 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.41 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  45.45 
 
 
208 aa  171  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  44.22 
 
 
203 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  43.48 
 
 
234 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  44.1 
 
 
197 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  44.39 
 
 
224 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.86 
 
 
218 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  44.5 
 
 
209 aa  168  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  44.72 
 
 
203 aa  167  8e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  45.63 
 
 
232 aa  167  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  51.98 
 
 
217 aa  167  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.67 
 
 
210 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  43.06 
 
 
208 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.19 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  50.26 
 
 
219 aa  165  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  45.89 
 
 
225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  44.5 
 
 
217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  164  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.26 
 
 
213 aa  164  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  43.06 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  44.17 
 
 
236 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.83 
 
 
219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.84 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  47.47 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  48.88 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.02 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  44.28 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  42.58 
 
 
208 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.27 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  45.77 
 
 
211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  44.5 
 
 
216 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  46.46 
 
 
213 aa  161  8.000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.5 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.35 
 
 
205 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  42.33 
 
 
223 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.66 
 
 
226 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.19 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  46.08 
 
 
209 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.2 
 
 
212 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  41.23 
 
 
209 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  41.59 
 
 
730 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  44.5 
 
 
662 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  47.26 
 
 
197 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  43.48 
 
 
234 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42.86 
 
 
211 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>