193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20210 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
565 aa  1140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  34.62 
 
 
584 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  33.92 
 
 
589 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  32.04 
 
 
577 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  33.45 
 
 
612 aa  254  4e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  32.92 
 
 
563 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  32.92 
 
 
561 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  28.17 
 
 
575 aa  248  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  47.33 
 
 
564 aa  245  2e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  33.39 
 
 
571 aa  244  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  32.39 
 
 
585 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  32.92 
 
 
611 aa  243  8e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  30.52 
 
 
547 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  31.6 
 
 
590 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  30.93 
 
 
616 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  30.3 
 
 
557 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  31.48 
 
 
557 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1253  Type I restriction enzyme EcoAI specificity protein  44.36 
 
 
597 aa  227  5e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00376854  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  30.25 
 
 
633 aa  227  5e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  28.35 
 
 
561 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  7.95371e-05 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  40.58 
 
 
575 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  30.82 
 
 
578 aa  222  2e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  33.2 
 
 
511 aa  220  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  30.48 
 
 
476 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.09 
 
 
572 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  28.03 
 
 
565 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  29.3 
 
 
528 aa  179  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  48.26 
 
 
450 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  42.6 
 
 
469 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  29.15 
 
 
576 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  26.94 
 
 
532 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  52.52 
 
 
211 aa  149  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.15 
 
 
429 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  28.64 
 
 
398 aa  142  2e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.76 
 
 
459 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.78 
 
 
520 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.13 
 
 
556 aa  135  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.83 
 
 
471 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  44.12 
 
 
429 aa  134  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  40.7 
 
 
432 aa  133  7e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.56 
 
 
477 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  35.55 
 
 
453 aa  129  1e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  39.52 
 
 
538 aa  129  1e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  40.57 
 
 
422 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.91 
 
 
385 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  34.12 
 
 
419 aa  117  7e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  35.96 
 
 
405 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  25.89 
 
 
447 aa  112  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  40.51 
 
 
471 aa  112  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  36.84 
 
 
429 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  36.22 
 
 
463 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  34.13 
 
 
440 aa  111  4e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  39.47 
 
 
400 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  35.35 
 
 
396 aa  110  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  6.81459e-08  hitchhiker  1.69581e-06 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  36.94 
 
 
387 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  35.29 
 
 
846 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.02 
 
 
390 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  38.04 
 
 
834 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  28.22 
 
 
456 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0371  type I restriction-modification system S subunit  32.37 
 
 
323 aa  103  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  34.73 
 
 
447 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  38.04 
 
 
393 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.44 
 
 
444 aa  100  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.89 
 
 
457 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  27.52 
 
 
487 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  34.55 
 
 
412 aa  97.8  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  33.15 
 
 
364 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  32.56 
 
 
442 aa  97.4  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.69 
 
 
408 aa  94.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  23.83 
 
 
492 aa  94  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  29.59 
 
 
417 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  33.14 
 
 
402 aa  91.3  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.64 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  28.16 
 
 
439 aa  90.1  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  34.25 
 
 
398 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  24.77 
 
 
479 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.06 
 
 
456 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  27.35 
 
 
417 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.78 
 
 
406 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  29.05 
 
 
649 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  30.69 
 
 
427 aa  86.3  1e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.29 
 
 
427 aa  85.9  2e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  30.06 
 
 
416 aa  84.3  5e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.46 
 
 
422 aa  84  6e-15  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  31.41 
 
 
549 aa  83.6  9e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  31.55 
 
 
428 aa  83.6  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  23.24 
 
 
460 aa  82.4  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2740  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  29.48 
 
 
162 aa  82  2e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0987272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  29.7 
 
 
415 aa  81.6  4e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  24.75 
 
 
437 aa  81.3  5e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.5 
 
 
422 aa  80.5  7e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  27.97 
 
 
434 aa  80.5  7e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  31.03 
 
 
426 aa  79.7  1e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  32.24 
 
 
382 aa  79.3  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  28.19 
 
 
285 aa  76.3  2e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  30.33 
 
 
425 aa  75.1  3e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  31.17 
 
 
420 aa  74.3  6e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  30.8 
 
 
1343 aa  73.9  8e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.41 
 
 
419 aa  73.6  8e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.64 
 
 
462 aa  73.6  9e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>