195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19980 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  53.31 
 
 		 309 aa  295  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  50.68 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  53.21 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  56.68 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  51.96 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  53.24 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  51.07 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  51.18 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  50.89 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  50.53 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  50.53 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  50.53 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  49.47 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  48.07 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 312 aa  252  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  55.2 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  50.72 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  51.61 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  48.46 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  49.28 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  48.93 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 305 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  49.47 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  51.6 
 
 		 640 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  47.22 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 		 299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  51.79 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.82 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  47.72 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.93 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  50 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.93 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.64 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  49.46 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  51.79 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  48.59 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.29 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  49.64 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.48 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  45.51 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  45.18 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  48.2 
 
 		 292 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  44.96 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  45.52 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  47.48 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  46.26 
 
 		 287 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.04 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  46.95 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.3 
 
 		 584 aa  192  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  43.86 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 363 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  63.83 
 
 		 120 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1236  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  25.87 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  24.88 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  30.33 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5242  monosaccharide-transporting ATPase  25.7 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1363  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.36 
 
 		 394 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  27.23 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  27.23 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  27.04 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.4 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  27.43 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>