More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18700 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  100 
 
 
514 aa  1037    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  55.64 
 
 
580 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  55.14 
 
 
585 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  46.05 
 
 
568 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.85 
 
 
568 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.65 
 
 
568 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.03 
 
 
553 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.7 
 
 
520 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.63 
 
 
568 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  50.55 
 
 
567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  46.07 
 
 
521 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  46.02 
 
 
557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  49.37 
 
 
514 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  57.51 
 
 
520 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  50.1 
 
 
575 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  46.23 
 
 
566 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  54.66 
 
 
566 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  57.51 
 
 
520 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  54.66 
 
 
566 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  54.2 
 
 
578 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  44.55 
 
 
568 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  45.72 
 
 
599 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  55.56 
 
 
573 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.75 
 
 
568 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.72 
 
 
599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.44 
 
 
603 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.89 
 
 
558 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.09 
 
 
520 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  43.6 
 
 
558 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  47.12 
 
 
585 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  51.85 
 
 
520 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  52.3 
 
 
503 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  53.28 
 
 
575 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.31 
 
 
563 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  46.99 
 
 
570 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  50.98 
 
 
489 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  54.06 
 
 
585 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  51.28 
 
 
500 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.53 
 
 
599 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  51.79 
 
 
561 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  53.32 
 
 
518 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.33 
 
 
568 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  53.73 
 
 
518 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.22 
 
 
568 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  49.17 
 
 
499 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  51.02 
 
 
501 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  51.01 
 
 
559 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  53.18 
 
 
513 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  51.35 
 
 
515 aa  425  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  53.98 
 
 
518 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.38 
 
 
871 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.14 
 
 
571 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.14 
 
 
577 aa  418  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  48.16 
 
 
502 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  53.23 
 
 
487 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.73 
 
 
568 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.14 
 
 
568 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  52.81 
 
 
502 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  52.22 
 
 
563 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.28 
 
 
568 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  53.87 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
571 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  42.83 
 
 
563 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  52.99 
 
 
533 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.55 
 
 
571 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  46.17 
 
 
523 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  52.67 
 
 
578 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  46.94 
 
 
524 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  45.73 
 
 
523 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  44.73 
 
 
514 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  50.37 
 
 
523 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.75 
 
 
521 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  52.93 
 
 
491 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  52.84 
 
 
468 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  46.17 
 
 
497 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  51.71 
 
 
503 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  52.84 
 
 
495 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  52.58 
 
 
522 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
514 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.12 
 
 
564 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.8 
 
 
557 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  53.09 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  49.11 
 
 
561 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  45.95 
 
 
521 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  46.17 
 
 
521 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.99 
 
 
557 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  53.09 
 
 
499 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  52.15 
 
 
566 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  51 
 
 
471 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  53.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  53.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  53.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  53.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  53.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  53.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  49.75 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  49.88 
 
 
521 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  53.09 
 
 
498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.77 
 
 
553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  46.83 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>