113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18280 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  27.33 
 
 
361 aa  78.2  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  31.25 
 
 
784 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  36.88 
 
 
485 aa  71.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  30.34 
 
 
932 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  28.19 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  41.03 
 
 
343 aa  68.2  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  29.38 
 
 
330 aa  68.2  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  29.52 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  40.45 
 
 
468 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  31.9 
 
 
400 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  28.92 
 
 
919 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  31.9 
 
 
400 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  26.88 
 
 
424 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  35.9 
 
 
593 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  34.53 
 
 
591 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
641 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  34.75 
 
 
551 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  30.83 
 
 
694 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  44.07 
 
 
403 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  44.07 
 
 
403 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  33.05 
 
 
586 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  33.05 
 
 
586 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  33.05 
 
 
666 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  33.05 
 
 
666 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  31.18 
 
 
1036 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  29.65 
 
 
673 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  27.38 
 
 
416 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  32.48 
 
 
581 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  32.77 
 
 
658 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  32.77 
 
 
629 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  32.48 
 
 
581 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  32.86 
 
 
539 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  31.82 
 
 
578 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  31.93 
 
 
604 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  32.28 
 
 
632 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  27.67 
 
 
946 aa  52  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  32.28 
 
 
645 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  30.61 
 
 
574 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  38.1 
 
 
408 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  31.09 
 
 
606 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  31.06 
 
 
622 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  35.06 
 
 
536 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  29.61 
 
 
561 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  32.86 
 
 
548 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  30.53 
 
 
563 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  27.07 
 
 
600 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  27.46 
 
 
466 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  29.14 
 
 
550 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  29.5 
 
 
643 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.98 
 
 
1029 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  28.85 
 
 
624 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  33.09 
 
 
543 aa  48.5  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.61 
 
 
518 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  29.17 
 
 
572 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  43.64 
 
 
3027 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  38.1 
 
 
575 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  29.17 
 
 
533 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  29.41 
 
 
581 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  28.91 
 
 
531 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  30 
 
 
513 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.57 
 
 
561 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  29.73 
 
 
500 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  31.67 
 
 
491 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  32.31 
 
 
466 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.84 
 
 
693 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  41.51 
 
 
261 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  27.34 
 
 
466 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  34.21 
 
 
531 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  27.72 
 
 
571 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  28.33 
 
 
639 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  43.18 
 
 
506 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  27.84 
 
 
318 aa  45.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  44.44 
 
 
1226 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  35.62 
 
 
461 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  35.62 
 
 
461 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  30.77 
 
 
518 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  35.62 
 
 
461 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  35.62 
 
 
461 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  37.25 
 
 
546 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  30.25 
 
 
524 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  40.35 
 
 
218 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  38.78 
 
 
1821 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  29.41 
 
 
528 aa  45.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  29.03 
 
 
758 aa  44.7  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  33.72 
 
 
518 aa  45.1  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  33.8 
 
 
857 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.44 
 
 
767 aa  44.7  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  31.01 
 
 
926 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.78 
 
 
558 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  30.25 
 
 
510 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  29.91 
 
 
475 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  29.41 
 
 
514 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 
1321 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  36.36 
 
 
548 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  28.67 
 
 
542 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  38.33 
 
 
935 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  32.76 
 
 
413 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  26.92 
 
 
544 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  36.11 
 
 
807 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>